平成元年.8 Ｌ･Ｌ教室 ヘッドホーン総入れ替え。
平成 2. 6.30 プールサイド凍上剥離の危険防止（ユニットマット）工事完了。
平成 2.10. 6 パソコン教室新設工事完了。
平成 3. 4. 1 第14代 小山利久校長就任。
平成 3.12. 4 スクールバス新車購入。
平成 5. 2.12 部活動再編成による新部活動発足。
平成 6. 4. 1 第15代 佐藤洋一校長就任。
平成 7.10.31 校舎大規模改修・体育館暖房設備新設工事完了。
平成 8.10. 5 創立50周年記念式典記念講演 数学者ピーター・フランクル氏。
平成 9. 1.25 南牧村中学生海外研修事業 10名の生徒がニュージーランドへ。
平成 9. 4. 1 第16代 白石幸男校長就任。
平成10. 4.21 創立50周年記念植樹完了。(ヤマナシ・コブシ・ナツツバキ）
平成10.10. 4 南佐久郡ＰＴＡ研究集会会場校となる。
平成10.12.21 海尻地区生徒ＪＲ通学開始。
平成11. 2. 6 第３回南牧村中学生海外研修授業（ニュージーランド）生徒２０名参加
平成11. 4.12 市場地区生徒スクールバス通学開始。
平成11.10.27 パソコン新機種に交換。
平成12. 2. 5 第４回南牧中学生海外研修事業（ニュージーランド）生徒２０名参加
平成12. 6. 1 インターネット及びwebページ開設。
平成12. 8.20 調理場ドライシステム化改装工事完了。
平成13. 2. 3 第５回南牧村中学生海外研修事業（ニュージーランド）生徒２０名参加。
平成13. 4. 1 第17代 山本由幸校長就任。
平成13. 8.17 第６回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒３０名参加。
平成13. 9.19 防犯ブザー各教室に設置。
平成13. 3. 5 校舎周辺に夜間灯を３基設置。
平成14. 7.31 南牧村ＡＥＴ ティファニー・ナイト先生着任
平成14. 8.16 第７回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒２６名参加
平成14. 8.22 管理棟雨漏工事完了
平成15. 1.31 学校給食学校表彰 優良賞受賞
平成15. 3.28 校内ＬＡＮ工事・パソコン新機種に交換
平成15. 8.16 第８回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒４０名参加
平成15. 8.29 国から「南牧こまやか教育特区」認可される １学年４０名以下で２クラス編成
平成15. 8.22 体育館雨漏工事完了
平成15.11.28 グランド防球ネット設置
平成16. 3.26 スクールバス新車購入
平成16. 4. 1 南牧こまやか教育特区により１学年３４名２クラスに
平成16. 8.14 第９回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒４３名参加
平成17. 4. 1 第18代 小林雅彦校長着任
平成17. 7. 6 プールに温水シャワー設置
平成17. 8. 8 第１０回南牧中学生海外研修（カナダ）生徒３３名参加
平成17. 8.18 南牧村ＡＬＴ（リサ・リチャードソン先生）着任
平成18. 2.17 本校前国道に信号機設置
平成18. 3. 9 体育館のステージ緞帳交換
平成18. 8. 8 第１１回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒３０名参加
平成18. 8.10 ランチルーム、職員室、校長室に網戸設置
平成18. 8.22 教室黒板の張り替え工事完了
平成18. 8.24 南牧村ＡＬＴ（アナスタジアマリー先生）着任
平成18.10. 5 体育館グランドピアノ 菊池八郎様より寄贈
平成19. 4. 1 第19代 清水豊喜校長就任
平成19. 8.10 第１２回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒３６名参加
平成19. 8.20 普通教室等落下防止柵設置
平成19. 9.30 大嶋一精氏より、石油貯留岩・鉱物・化石標本寄贈
平成20. 2. 2 本校前国道の信号機、感応式となる。
平成20. 6.13 プール改修工事完了
平成20. 8.12 第13回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒37名参加
平成20. 8.22 南牧村ＡＬＴ（メ―ガン・ヒュースビー先生）着任
平成20.10. 2 西ドーム屋根改修工事完了
平成21. 5.29 特別教室棟落下防止柵設置
平成21. 6.22 プール更衣室・プールトイレ改修工事完了
平成21. 7.12 本校前国道の信号機に「南牧中学入口」の名前プレートが付く。
平成21. 8.11 第14回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒30名参加
平成21. 8.18 パソコン教室及び職員室に新型パソコン引渡
平成21.10. 8 台風１８号のため臨時休校
平成21. 3.25 片側のみであった階段手すりを全階段で両側にあるように設置
平成22. 4. 1 第20代 佐々木章文校長就任
平成22. 7.30 体育館照明工事完了
平成22. 8. 1 第15回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒27名参加
平成22. 8. 3 校庭グランド進入階段修繕工事完了
平成22. 8.11 体育館、職員室放送機器改修工事完了
平成22.10. 2 生徒棟・特別棟間ドーム床フローリング工事
平成22.10. 7 体育館遠赤外線暖房機修繕工事完了
平成22.10.16 南佐久郡ＰＴＡ連合会研修会会場校
平成22.11.26 保健室網戸設置工事
平成23. 8. 9 第16回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒35名参加
平成23. 8.26 ドーム雨漏り止水工事完了
平成23. 8.26 ボイラーを撤去し、管理教室棟、普通教室棟ＦＦ化完了
平成24. 1. 南牧村ＡＬＴ（トレイシー・アルトン先生）着任
平成24.10. 文科省人権教育指定校２年次発表会
平成25. 6.11 プール濾過器入れ替え工事完了
平成25.10.16 台風２６号のため臨時休校
平成26. 2.17 大雪のため臨時休校（2/19まで）
平成26. 4. 1 第21代 武井 晃 校長着任
平成27. 7.27 第19回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒33名参加
平成28. 1.18 大雪のため臨時休校
平成28. 6.24 体育館、生徒棟、ドーム等雨漏り修繕工事完了
平成28. 8. 8 第20回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒31名参加
平成28. 8.17 ランチルーム照明ＬＥＤに交換
平成29. 5.27 全佐久ＰＴＡ連合会総会・佐久地区小中学校ＰＴＡ実践力向上研修会会場校
平成29. 8. 7 第21回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒10名参加
平成29.12.18 菊池八郎氏の寄付金でハイブリッド除雪機１台購入
平成30. 2.14 インフルエンザ流行のため臨時休校
平成30. 4. 1 第22代 関 武登 校長着任
平成30. 7. 6 普通教室棟窓、特別教室棟窓に網戸設置
平成30. 8. 3 普通教室棟、図書館などに扇風機24台、ほか冷風機などを設置
平成30. 8. 6 第22回南牧村中学生海外研修事業（カナダ）生徒30名参加
平成30. 9. 6 南牧村ＡＬＴ（デイビッド･トンプソン先生）着任
平成31. 2. 5 全国中学校スケート大会男子団体で53点を獲得し初優勝
平成31. 4. 1 パソコン室にタブレット型パソコン34台導入
